የስነ-ጽሑፍ መጋራት፡- በምዕራብ አፍሪካ የዱር ትናንሽ አጥቢ እንስሳት የቫይሮም ፕሮፋይል ማድረግ አዳዲስ ቫይረሶችን እና የዞኖቲክ አደጋዎችን ያሳያል

በቅርቡ የታተመ አንድ ጥናት እ.ኤ.አ.ማይክሮባዮምበምዕራብ አፍሪካ፣ ሴራሊዮን ውስጥ የተሰበሰቡ 846 የዱር ትናንሽ አጥቢ እንስሳት - የሌሊት ወፎችን፣ አይጦችን እና ሽሩዎችን ጨምሮ - የቫይረስ ሜታጂኖሚክ ትንተና አካሂዷል። ጥናቱ በአጠቃላይ 39 ከአጥቢ ​​እንስሳት ጋር የተያያዙ አር ኤን ኤ ቫይረሶችን ለይቷል፣ እነዚህም 26 አዳዲስ እና 13 ቀደም ሲል የታወቁ ቫይረሶችን ያካትታሉ። ከእነዚህም መካከል የፓራሚክሶቪሪዳ ቤተሰብ ከፍተኛውን ልዩነት አሳይቷል፣ አይጦች ደግሞ ከፍተኛውን የቫይረስ ዝርያዎችን ይይዛሉ (n = 26)።

የዞኖቲክ ስጋት ግምገማ ሦስት የሚታወቁ የዞኖቲክ ቫይረሶችን አሳይቷል - የኢንሰፍላሎሚዮካርዲተስ ቫይረስ፣ የላሳ ቫይረስ እና የሮካሄፔቫይረስ ስፒ - እንዲሁም የመውጣት አደጋ ያላቸው ሶስት ቫይረሶች፡ ሜሊያን ቫይረስ፣ የአይጥ ሄፓታይተስ ቫይረስ እና ሁኒቫይረስ ኤ። በተለይም፣ አዲስ ከተለዩት ቫይረሶች መካከል፣ የባት ሌዳንቴቫይረስ 2 ከሰው ልጅ ከሚበክለው የሌ ዳንቴክ ቫይረስ ጋር በጣም ቅርብ የሆነውን የፊሎጄኔቲክ ግንኙነት አሳይቷል። የሴሮሎጂ ትንተና በተጨማሪም በ2.8% የአካባቢው ነዋሪዎች ላይ ከዚህ ቫይረስ ጋር የሚቃረኑ ፀረ እንግዳ አካላትን አግኝቷል፣ ይህም ቀደም ብሎ፣ ምናልባትም ያልታወቀ፣ በሰው ላይ መጋለጥን ያሳያል።

እነዚህ ግኝቶች በምዕራብ አፍሪካ ውስጥ ከፍተኛ መጠን ያለው በአይጦች የሚመራ የቫይረስ ማጠራቀሚያ መኖሩን ያጎላሉ እና በሰው-እንስሳት በይነገጽ ውስጥ የተቀናጀ የክትትል ስልቶችን ወሳኝ ጠቀሜታ ያጎላሉ። የሜታጂኖሚክ ምርመራን ከሴሮሎጂካል ማረጋገጫ ጋር ማዋሃድ የዞኖቲክ እና የስርጭት አቅም ያላቸውን ቫይረሶች ለመለየት ጠንካራ ማዕቀፍ ይሰጣል።

ባለፉት አስርት ዓመታት ውስጥ፣ ከ60% በላይ የሚሆኑት በሰው ልጆች ላይ የሚከሰቱ ተላላፊ በሽታዎች ከእንስሳት ማጠራቀሚያዎች የመጡ ናቸው፣ የሌሊት ወፎች፣ አይጦች እና ሽሩዎች የዞኖቲክ ቫይረሶች ዋና አስተናጋጆች እንደሆኑ ይታወቃሉ። አፍሪካ በሰፊው የዞኖቲክ በሽታዎች ማዕከል እንደሆነች ተደርጋ ትቆጠራለች። ለምሳሌ፣ ሴራሊዮን ከ2014-2016 የኢቦላ ወረርሽኝ ወቅት ከ28,000 በላይ ጉዳዮችን ሪፖርት አድርጋለች።

በዚህ ክልል ውስጥ የዞኖቲክ በሽታዎች ከፍተኛ ጫና ቢኖርም፣ በዱር ትናንሽ አጥቢ እንስሳት ውስጥ የቫይረሶች ልዩነት እና ስርጭት በቂ አይደለም። ይህንን ክፍተት ለመፍታት ተመራማሪዎች በ2018 እና 2023 መካከል በሴራሊዮን በሦስት ቦታዎች በተያዙ 846 የዱር ትናንሽ አጥቢ እንስሳት ላይ ስልታዊ የቫይረስ ትንተና አካሂደዋል። ጥናቱ የቫይረስ ልዩነትን ለመለየት፣ የተለያዩ ዝርያዎችን የመተላለፍ አቅም ያላቸውን እጩዎች ለመለየት፣ የዞኖቲክ አደጋን ለመገምገም እና ለሚከሰቱ ተላላፊ በሽታዎች ቅድመ ማስጠንቀቂያ ስርዓቶችን ለመደገፍ ማስረጃ ለማመንጨት ያለመ ነው።

ዋና ዘዴዎች

ጥናቱ አጠቃላይ የቫይረስ ሜታጂኖሚክስ የስራ ፍሰትን ተግባራዊ አድርጓል፡

• የናሙና ሂደት፡የልብ፣ የጉበት፣ የስፕሊን፣ የሳንባ እና የኩላሊት ሕብረ ሕዋሳት ተሰብስበው፣ ተሰባስበው፣ ተመሳሳይነት ባለው መልኩ ተቀርፀው እና ሙሉ በሙሉ የአር ኤን ኤ እንዲወጣ ተደርጓል።
• ቅደም ተከተል እና ስብሰባ;የሪቦሶማል አር ኤን ኤ መሟጠጥ በቤተ መፃህፍት ግንባታ ከመደረጉ በፊት ተካሂዷል፣ ከዚያም በኢሉሚና ኖቫሴክ 6000 መድረክ በመጠቀም ከፍተኛ የውጤት ቅደም ተከተል ተከናውኗል። የቫይረስ ኢንፌክሽኖች በኖቮ ተሰብስበዋል።
• የቫይረስ መለየት፡ቫይረሶች በRNA-ጥገኛ RNA ፖሊመሬዝ (RdRp) የጂን አሰላለፍ ላይ በመመስረት ተለይተዋል። ከአከርካሪ አጥንት ጋር የተያያዙ ቫይረሶች ብቻ ተጠብቀዋል፣ የባክቴሪያ፣ የፈንገስ እና የእፅዋት ቫይረሶችን ሳይጨምር።
• የባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና፡የፊሎጄኔቲክ መልሶ ግንባታ፣ የሪኮምቢኔሽን ትንተና፣ የዝርያዎች መተላለፊያ አውታረ መረብ ሞዴሊንግ እና የዞኖቲክ ስጋት ግምገማ ተካሂዷል።
• የሴሮሎጂካል ማረጋገጫ፡ለባት ሌዳንቴቫይረስ 2 በቪኤስቪ ላይ የተመሠረተ የፕሱዶቫይረስ ገለልተኛ ምርመራ ተዘጋጅቷል። ገለልተኛ ፀረ እንግዳ አካላት በ2.8% የሰው ሴራ ውስጥ ተገኝተዋል፣ ይህም የዞኖቲክ ስርጭት ሊኖር እንደሚችል የሚያሳይ ማስረጃ ነው።
  

  ጥናትውጤቶች

  1. የቫይረስ ግኝት እና ልዩነት

  ይህ ጥናት በሴራሊዮን ውስጥ በተሰበሰቡ 846 የዱር እንስሳት ላይ የትራንስክሪፕቶሚክ ሴኩዊንሲንግ ትንተና አካሂዷል፣ ከእነዚህም ውስጥ አይጦችን፣ የሌሊት ወፎችን እና ሽሩዎችን ጨምሮ። ሙሉ በሙሉ በRNA-ጥገኛ RNA polymerase (RdRp) የጂን ቅደም ተከተሎች ላይ በመመስረት፣ በአጠቃላይ 39 ከአጥቢ ​​እንስሳት ጋር የተያያዙ RNA ቫይረሶች ተለይተዋል፣ እነዚህም ቀደም ሲል የታወቁ 13 ቫይረሶችን እና 26 አዳዲስ ቫይረሶችን ያካትታሉ።

  በቫይረስ ቅንብር ረገድ፣ የፓራሚክሶቪሪዳ ቤተሰብ በሦስቱም የአስተናጋጅ ትዕዛዞች ውስጥ ከፍተኛውን የልዩነት ደረጃ አሳይቷል፣ በመቀጠልም አስትሮቪሪዳ እና ፒኮርናቪሪዳ ይከተላሉ። የአስተናጋጅ ስርጭትን በተመለከተ፣ አይጦች ከፍተኛውን የቫይረስ ልዩነት አስተዋፅዖ አድርገዋል፣ በአጠቃላይ 26 የቫይረስ ዝርያዎችን ይይዛሉ፣ ይህም በክልሉ ውስጥ የቫይረስ ልዩነት ማጠራቀሚያዎች ሆነው ከፍተኛ ሚና እንዳላቸው ያሳያል።

  2. የእንስሳት መካነ አራዊት አደጋ

  የዞኖቲክ ስጋት ግምገማ ሦስት የሚታወቁ የዞኖቲክ ቫይረሶችን ለይቷል፤ እነሱም የኢንሰፍላሎምዮካርዲተስ ቫይረስ፣ የላሳ ቫይረስ እና የሮካሄፔቫይረስ ዝርያዎች ናቸው። በተጨማሪም፣ ሦስት ቫይረሶች - ሜሊያን ቫይረስ፣ የአይጥ ሄፓታይተስ ቫይረስ እና የሁኒቫይረስ ኤ - የመውረር አደጋ እንዳለባቸው ተለይተዋል።

  አዲስ ከተገኙት 26 ቫይረሶች መካከል አራቱ በፊሎጄኔቲክ እና በጂኖሚክ ባህሪያት ላይ ተመስርተው ከፍተኛ የዞኖቲክ አቅም እንዳላቸው ተንብየዋል። በተለይም፣ የባት ሌዳንቴቫይረስ 2 ከታዋቂው ሰው-በማስተላለፊያው Le Dantec ቫይረስ ጋር በጣም ቅርብ የሆነውን የፊሎጄኔቲክ ግንኙነት አሳይቷል።

  ቀጣይ የሴሮሎጂ ምርመራ ይህንን ግኝት የበለጠ ደግፏል፣ ምክንያቱም ከአካባቢው ነዋሪዎች በ2.8% በሚሆኑ ሴራዎች ውስጥ በባት ሌዳንቴቫይረስ 2 ላይ የሚያሳድሩትን ገለልተኛ ፀረ እንግዳ አካላት ተገኝተዋል። ይህ ውጤት ያልታወቁ ወይም ምልክት የሌላቸው ኢንፌክሽኖች በሰው ልጅ ህዝብ ውስጥ ተከስተው ሊሆን እንደሚችል ይጠቁማል፣ ይህም ቀደም ሲል ያልታወቀ የዞኖቲክ ስርጭት መንገድን ያሳያል።

  3. የዝርያ መተላለፊያ ተለዋዋጭነት

  የዘር ግንድ ስርጭት ትንተና እንደሚያሳየው አይጦች በቫይረስ መጋራት አውታረ መረብ ውስጥ ማዕከላዊ ቦታ ይይዛሉ፣ በአስተናጋጅ ዝርያዎች መካከል የቫይረስ ልውውጥን የሚያመቻቹ ቁልፍ ኖዶች ሆነው ያገለግላሉ። በአጠቃላይ 15 ቫይረሶች የዘር ግንድ ስርጭትን የማድረግ አቅም እንዳላቸው ተለይተዋል።

  ስለ መስቀል-ትዕዛዝ ስርጭት ቅጦች ተጨማሪ ትንተና እንደሚያሳየው የቫይረስ መጋራት በተመሳሳይ ታክሶኖሚክ ቅደም ተከተል ውስጥ ባሉ አስተናጋጆች መካከል በተደጋጋሚ የሚከሰት ሲሆን ይህም የአስተናጋጅ ዝምድና በማስተላለፊያ ተለዋዋጭነት ውስጥ ትልቅ ሚና እንደሚጫወት ይጠቁማል። በተቃራኒው፣ የሌሊት ወፎች ለመስቀል-ትዕዛዝ ስርጭት በአንጻራዊ ሁኔታ ዝቅተኛ አቅም አሳይተዋል።

  በተለይም፣ በተወሰኑ ቫይረሶች ውስጥ የአስተናጋጅ ክልል መስፋፋት ማስረጃ ታይቷል። ለምሳሌ፣ ቀደም ሲል ለሽሩዎች ብቻ ተብሎ የሚታሰበው የሜሊያን ቫይረስ በዚህ ጥናት ውስጥ በአይጦች ላይም ተገኝቷል፣ ይህም በአስተናጋጅ ተለዋዋጭነት ላይ ሊከሰት የሚችል ለውጥ እና ሰፊ የመተላለፍ አደጋን ይጨምራል።

  

  መደምደሚያዎች እና የህዝብ ጤና አንድምታዎች

  • በዱር ትናንሽ አጥቢ እንስሳት ውስጥ ከፍተኛ የቫይረስ ልዩነት;26 አዳዲስ ዝርያዎችን ጨምሮ 39 የአር ኤን ኤ ቫይረሶች መገኘታቸው በክልሉ ውስጥ ትልቅ የቫይረስ ክምችት መኖሩን ያሳያል እና ለመጀመሪያ ጊዜ ከፍተኛ የዞኖቲክ አቅም ያላቸው አዳዲስ ቫይረሶችን ሪፖርት አድርጓል (ለምሳሌ፣ የባት ሌዳንቴቫይረስ 2)።
  • አይጦች እንደ ቅድሚያ የሚሰጣቸው የክትትል ኢላማዎች፡አይጦች ለቫይረስ ስርጭት ቁልፍ ማዕከል ሆነው ያገለግላሉ እና ከፍተኛውን የቫይረስ ልዩነት ይይዛሉ፣ ይህም ከፍተኛውን የስርጭት አደጋን ይወክላል።
  • የተዋሃዱ የክትትል ስልቶች አስፈላጊነት፡ግኝቶቹ አይጦችን በንቃት የክትትል ፕሮግራሞች ውስጥ ቅድሚያ መስጠትን እና በሰው-ዱር እንስሳት በይነገጾች ላይ ሜታጂኖሚክስን፣ ሴሮሎጂን እና ሥነ-ምህዳራዊ ክትትልን በማጣመር የተቀናጁ አቀራረቦችን ተግባራዊ ማድረግን ይደግፋሉ።

  በአጠቃላይ፣ ይህ ጥናት ለታዳጊ የዞኖቲክ በሽታዎች የቅድመ ማስጠንቀቂያ ስርዓቶችን እና የአደጋ ግምገማ ማዕቀፎችን ለመደገፍ ወሳኝ ማስረጃዎችን ያቀርባል፣ ይህም በከፍተኛ ተጋላጭነት ባላቸው ክልሎች ውስጥ የቅድመ ክትትል አስፈላጊነትን ያጠናክራል።

  የምርት መረጃ